A szénhidrátok átalakulása szervezetünkben kétféle úton történik: oxigénmentes és oxigén-dús környezetben.
Oxigénmentes környezetet izommunka esetében találunk szöveteinkben. Az oxigénmentes környezetben végbemenő szénhidrát átalakulását fermentációnak, illetve glikolízisnek nevezzük. Ez egy bonyolult folyamat, melynek során összegezve glukózból tejsav képződik plusz energia-dús ATP. Ezek a folyamatok megfordíthatók, vagyis tejsavból képződhet cukorfoszfát illetve glikogén. A szervezet valóban termel is az izom ilyen módon nagy mennyiségű glikogént, az izommunkát követő pihenés időszakában, de erős izommunka során a tejsav mennyisége túl nagy már ahhoz, hogy valamennyit feldolgozza. A tejsav nagy része a májban kerül feldolgozásra, vagyis glikogénképzésre. Az izom, a vér és a máj tehát szakadatlan kapcsolatban van egymással.
Ha a szénhidrátok lebomlása oxigén-dús környezetben történik akkor bonyolult körfolyamat során széndioxid keletkezik melyet kilélegzünk.
A szénhidrátok bonyolult feldolgozásának szabályozása főleg hormonális úton történik. Ebben fontos szerepet töltenek be a hasnyálmirigy, a mellékvese, a hipofízis és a pajzsmirigy hormonjai. Legjelentősebb hormon a közismert inzulin. A szénhidrátok feldolgozásában nagy számban részt vesznek a vitaminok is. Különösen jelentős a B-vitaminok csoportjának szerepe.